论文标题

使用记忆中的处理与波前算法进行高通量成对对齐

High-throughput Pairwise Alignment with the Wavefront Algorithm using Processing-in-Memory

论文作者

Diab, Safaa, Nassereldine, Amir, Alser, Mohammed, Luna, Juan Gómez, Mutlu, Onur, Hajj, Izzat El

论文摘要

我们表明,与服务器级的多线程CPU系统相比,波前算法可以在Upmem PIM系统上获得更高的成对读取对齐吞吐量。

We show that the wavefront algorithm can achieve higher pairwise read alignment throughput on a UPMEM PIM system than on a server-grade multi-threaded CPU system.

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